玩家可以在游戏中长按BACK键开启PDA手机功能。玩家可以查看已有任务的位置，也可以按X键在指定位置划界。当玩家标记好要去的地方后，可以在游戏画面上看到引导箭头的指示，只要按照指示的方向走就可以到达目的地。
除了PDA手机的上述功能外，游戏中还有很多必须知道的游戏信息：比如屏幕右下角的任务信息，只要玩家在游戏中炸毁敌人的重要设施或载具，可以让所有的东西都获得一定的混沌值。只要达到开启任务所需的混沌值，即可解锁新任务并自动更新地图信息；玩家还可以将指示器移动到任务点并按下手柄。按A查看完成任务可获得的奖励和混沌。
为了获得更多的混乱，玩家可以摧毁每个城市和村庄的敌方设施，或者参加额外的挑战任务，这可以给玩家带来很多混乱。值得一提的是，在每个城市和村庄的名称之后正当防卫2有战斗飞机吗，都会有一个百分比计算项，用来表示已经被破坏的设施，以及该区域内获得的升级包的总百分比。另外，获得更多的混沌值也会影响玩家在黑市上能买到的武器装备。
玩家在游戏中可以执行的任务主要分为三种类型：代理、据点和派系；代理任务是主要任务，而派系任务是所谓的副任务。最特别的任务之一是要塞任务。玩家必须协助某个派系的地下军队占领地图上的各个区域。成功占领地图区域后，可解锁该区域的额外任务。
我爱黑市，黑市爱我
黑市是唯一提供玩家购买武器和车辆的商店。完成整个训练关卡后，玩家将自动获得召唤黑市直升机的工具。按十字键取出工具并按Y折腾按钮，可以直接将黑市直升机呼叫到指定位置。玩家可以在这里购买一些任务必需品，也可以使用游戏中捡到的升级包来强化已经解锁的武器和载具。每把武器都可以升级到6级，而且每一级都要花费相当数量的升级包，但是和未升级的武器相比，威力和射程都有很大的不同。
《正当防卫2》中也有共同的通缉价值设计。只要玩家在基地或道路上射击敌人，屏幕左上方和右上方的通缉数量就会增加。会用更强大的手段对付玩家。然而，与《侠盗猎车手》不同的是，玩家对敌人派出的坦克和攻击直升机几乎束手无策。喜欢驾驶攻击直升机反击敌人的玩家，也可以故意增加一些通缉值，让敌人派出直升机进行攻击。然后你可以用钩索飞到驾驶座上做一个QTE，把司机扔到外面，就可以成功抢到直升机反击敌人。使用直升机攻击敌方基地是有优势的。玩家更容易找到散落在基地周围的升级包，只要获得一定数量的防护升级包，游戏会自动帮助玩家提升主角的最大生命值。
最后正当防卫2有战斗飞机吗，作者为敌人提供了一种超级欺骗手段。许多基地都有地对空跟踪导弹发射台。如果玩家在没有提前处置发射台的情况下直接击杀发射台，直升机很容易被击中爆炸。 玩家可以用钩子向发射台射击，另一端连接直升机，可以直接将发射台“拉起”，然后用发射台的残骸碾压敌人
