当代美国海军潜艇指挥官 (CO) 是中校 (Commander/O-4）, 执行官 (XO) 是少校 (Lieutenant Commander/O-3）, 军士长) - 高级士官（E-9））。与水面战舰不同，潜艇中士的头衔是船长（COB），而不是司令部士官长。三人共同组成了潜艇指挥部（指挥组）。潜艇军士长的职责与其他单位的军士长没有区别：1）指挥官的士兵（军官）代表和顾问，2）舰艇士兵（军官）负责人潜艇里的指挥官排列，3）参与在非战斗指挥决策中。
弗吉尼亚潜艇人员配备 - 14 名军官，120 名士兵（军官）
俄亥俄潜艇人员配备 - 15 名军官，140 名士兵（军官）
Wave Submarine 人员配备 - 14 名军官，126 名士兵（军官）
巡逻执勤时潜艇内部按职能划分为几个部门：以执行官为首的执行部（负责行政管理）、以工程官为首的工程部（负责维护动力系统），以及由武器官领导的武器。部（负责武器和战斗系统的支持和维护），以导航官为首的作战部（负责导航和通信），以供应官为首的供应部（负责后勤）。
现役俄亥俄级弹道导弹潜艇（SSBN，在美国俗称“轰炸机”）和巡航导弹潜艇（SSGN）拥有两个完整的团队，分为黄金船员和蓝色船员。一队在海上执勤训练，另一队在母港待命，准备下一次海上航行。
美国潜艇执勤时实行18小时制潜艇里的指挥官排列，分三班倒。每班工作6小时，剩下的12小时一半用于睡觉和休息，另一半用于训练、吃饭、自由活动和娱乐。为了激励军队，潜艇餐是美国海军最好的，分为四餐：早餐、午餐、晚餐和午夜口粮。
